卷上太阳方总论卷下阳明方总论少阳方总论太阴方总论少阴方总论厥阴方总论六经方余论
中风虚劳咳嗽失音肺痿呃逆吐血衄血便血哮喘痰饮痞疝积聚痹痿痉厥癫痫三消郁肿胀遗精淋浊呕吐噎膈吐蛔痛头风温热疫毒疹暑湿黄胆疟疾痢泄泻便闭五窍
伤寒审证表
柳选四家医案
叙卷一·琼瑶神书天部宋徽宗皇帝崇宁五年琼瑶真人一书手法序一琼瑶真人用升阳升阴气上气下之手法讲论歌二琼瑶标本运气歌三琼瑶辨十二经水火分治法四宋徽宗崇宁皇帝论五论手足阴阳流注篇六络脉传注周流不息七琼瑶真人
弁言序题词跋卷一卷二卷三卷四
序自序卷之上脉法脉诀歌金匮解（方附本条）逐月养胎辨并慎择医药论受胎试验法（附方）试男女胎法三禁教养宜忌论饮食七情禁忌论妊娠药忌歌种子补益受胎寿子论胎动安胎论恶阻论胞漏并小产论诸痛论（附孕痈）胎逆上逼胀
序上卷本症治法兼症治法变症治法疠疡类症本症治验类症治验中卷续治诸症下卷各症方药
第1部分第2部分第3部分第4部分
概述卷一阴阳颠倒篇顺逆探原篇回天生育篇天人寿夭篇命根养生篇救母篇红铅损益篇初生微论篇骨阴篇卷二媾精受妊篇社生篇天厌火衰篇经脉相行篇经脉终始篇经气本标篇脏腑阐微篇考订经脉篇包络配腑篇卷三胆腑命名篇任督死