序自序上集伤寒正名论王叔和辟泥四时论病之谬辟泥日数分经之谬论陶节庵论吴又可诸家编次司天运气分别阴阳十二经离合察脉大法寸口脉论趺阳少阴脉论脉分阴阳死生论仲景六经辨证与内经热病论互异辨中风一辨中风二辨中风
自序卷一一明望色之法望色论（附律一条）一明闻声之法闻声论（附律二条）一明辨息之法辨息论（附律一条）一明胸中大气之法大气论（附律一条）一明问病之法问病论（附律一条）一明切脉之法切脉论（附律一条）一明合色
伤寒兼证析义
总论幼科论治初生保胎外热内热辨非惊论痰火闭症木侮土症指纹晰义指纹切要小儿脉法初诞救护调燮须注意脐风症论初生后小儿之杂症治法婴儿护持得法可以避病说药饵不可轻服论不经医对病服药之误论观形象以辨寿夭论望形色
卷一明目赋（一）眼科论孙真人谕眼论阴阳相应辨论上古天真论眼科通明论轩辕黄帝说眼病目科四季五行发挥妙诀明目赋（二）太玄真人论眼病五轮所属太玄真人问眼病因论八廓所属八卦也论五轮受病之因论八廓受实热病之因论
金匮要略方论原序自叙后叙叙卷一脏腑经络 十六章脏腑经络一脏腑经络二脏腑经络三脏腑经络四脏腑经络五脏腑经络六脏腑经络七脏腑经络八脏腑经络九脏腑经络十脏腑经络十一脏腑经络十二脏腑经络十三脏腑经络十四脏腑经
自序祝序一·辨诊脉大法二·辨浮脉所统有十三·辨沉脉所统有五四·辨迟脉所统有五五·辨数脉所统有二六·辨滑脉所统有一七·辨涩脉八·辨肺大肠脉九·辨心小肠脉十·辨脾胃脉十一·辨肝胆脉十二·辨肾膀胱脉十三·辨
秘藏膏丹丸散方剂
石药尔雅
序自叙卷一朝廷对于医者之医方卷二世界对于医者之医方卷三医者自医之医方